科學灌溉是專業灌溉企業一直著力推廣的灌溉方式，包括滴灌、微噴、滲灌、噴灌等現代化的灌溉方式。需要根據相應植物的需水特性、生育階段、氣候、土壤條件等做合理設計，制定相應的灌溉制度，適時、適量，合理灌溉。該類方式可以做到局部精確灌溉，除了用于補充土壤水分滿足植物生長需要外，還可將肥料、農藥溶解在水中，結合注肥泵等現代化的施肥裝置進行施肥打藥作業。還可避免土壤鹽堿化，對已經出現鹽堿化的土壤，可利用灌溉沖洗土壤中的可溶鹽分，以改良土壤。此外科學灌溉方式還可起到預防果樹蔬菜霜凍和預防干熱風危害，以及防止土壤風蝕等作用。
